【2021年更新】
因えきねっと網站改版，改版後不提供一般周遊券之指定席訂位服務，
使用JR PASS者可改用以下網站預約指定席座位。
https://www.japanrailpass-reservation.net/
【以下為2010年至2020年資訊】
之前在日本用JR PASS都是直接到窗口劃位，
但常常遇到想搭的車子已經滿席，或是已經沒有想要的好位子。
畢竟JR的指定席是在開車前一個月就開始發售，
而外國觀光客通常是在搭車的前幾日(甚至當日)才抵達日本。
後來發現持JR PASS也可以用JR EAST的えきねっと網路訂位，
而且網站還附帶很多貼心的功能，
便都事先用這個網站訂位了。
此外，雖然えきねっと有提供給外國人用的英文版本，
不過英文版本可以預訂的列車比較少，
而且功能實在是太陽春了，
也沒有選位等貼心的功能，
因此如果讀得懂日文的話還是強烈建議使用日文版。
不過使用JR PASS搭配えきねっと訂位還是有限制的，大致是：
1. 必須在搭車前一日取票，所以無法預訂抵達日本當日的車票。
(JR東日本已修改規定，可於搭車當日取票，但仍需預留取票時間以免不及取票/乘車。)
2. 只能在JR東日本的車站取票。
(註：北陸新幹線通車後，部份路線的車票也可以在JR西日本北陸新幹線的車站取票。)
(註：北海道新幹線通車後，部份路線的車票也可以在JR北海道的車站取票。)
3. 無法預訂寢台列車。
4. 許多貼心的功能只有預訂JR東日本的列車才適用。
說穿了就是去東日本的時候才適合這個網站訂位，
如果只是去其他地方，不會經過東日本，
就不是那麼建議在這邊訂位了。
JR PASS、JR EAST PASS、JR EAST PASS SPECIAL等
都屬於フリーパス型的「特別企画乗車券」，
因此在訂位取票的規則上可以參考這裡。
信用卡資料以及驗證都是在註冊時就填好的，
因此訂位的時候不用再另外輸入，
只要選擇想搭的車子跟位子即可。
登入網站的順序如下：
在えきねっと首頁選擇「新幹線．特急のきっぷ予約．申込」→「ログイン」，
輸入帳密後就可以開始訂票了。
えきねっと提供許多讓使用者選擇列車的方式，
如果有兩個人要一起搭車，但是乘車區間不一樣，
(例如其中一個人想從東京搭到仙台，另一個人從上野搭到仙台)
也可以一次把票訂好。
但目前網站並不支援「減少人數」的功能，
訂位前請先確認好人數以免需要支付取消的手續費。
基本上除了「乗車券の申込」這個選項之外都是可以選的。
(乗車券の申込是購買乗車券用的，如果已經有PASS就不用另外買乗車券)
以下提供由「空席照会申込」進入後的流程畫面，
選擇搭乘路線、日期、出發時間、上下車站，再按確認，
網頁上便會列出可以訂購的班次。
(客滿的班次也是會顯示出來的)
接著選擇要訂的班次，
「座席種別」分為「普通」跟「グリーン」，
就看預計要買的PASS是哪一種而定。
表格的右半邊有
「指定席(所定料金)」、「指定席(トクダ值／乗車券つき)」、「自由席」三種選項，
使用PASS的話請務必選擇「指定席(所定料金)」這個選項，
如果選到自由席那就搞笑了。
也不能看到隔壁有10%割引就點下去，
那個是要連乗車券一起買的，PASS本身就已經有包含運賃，不需要再多花錢買一次。
接著就要選位子了，網站提供以下選擇：
A.条件を指定する
並び方の希望
「座席位置を特に指定しない」(不指定座位)
「窓側に限定する」(指定靠窗)
「通路側に限定する」(指定靠走道)
「列（A・B・C…）を指定する」(指定要A B C D E席)
車両内の位置の希望
「どちらでもいい」(坐哪都好)
「車両の両端以外」(靠車廂的中間)
「車両の端付近」(靠車廂的兩端)
B.シートマップ（座席表）で指定する(座位表指定座位)
可以的話當然要從座位表選一個好位子啦，
這可是英文網站享受不到的待遇。
但並不是所有的列車都可以這樣選，只有以下的列車才能由座位表選，
主要以JR東日本轄內的新幹線與特急為主。
如下圖所示，可以自己選擇車廂與座位，
這時候再搭配一本當期的「列車編成席番表」，
好位子就輕鬆入手了。
回到剛才的畫面，
座位號碼已經寫進去了。
接著要注意的是，若搭配JR PASS，
下面的「乗車券申込」要選擇「乗車券は申込まない」。
進入下一步，按確認後就完成訂位了。
在「申込‧購入内容を確認する」這裡可以看到訂位/取票記錄，
以及做訂位的變更。
原則上每個訂位記錄只能更改一次，超過一次的話就必須收取手續費。
但如果訂位的整段區間都是在 JR 東日本的範圍內，
(含「はくたか」越後湯沢～直江津、「踊り子」東京～伊豆急下田)
則可以不限次數免費變更。
這類訂位在訂位記錄上可以看到「え特変更」的淺綠色 logo，
且變更不限相同日期/區間/列車。
也就是說，
若原本訂的是長野到東京的あさま，
甚至可以換成八竿子打不著關係，甲府到小淵沢的スーパーあずさ。
最後是取票。
在以下頁面可以看到訂位、更改以及取票的記錄。
有很多「変更取消済」，這些都是使用「え特変更」，不用另收手續費的。
「購入予定代金」這欄是指定席特急料金的金額，
也是逾期未取罰款的金額。
不過實際拿著JR PASS去取票時，
是不用再任何錢的，信用卡也不會請款。
取完票後「発券状況」這欄會出現「発券済」以及取票日期，
「発券金額」這欄則會出現[合計:￥０]，
看幾萬元的指定席特急料金全部變成￥０真是有一股說不出的快感(誤)。
使用JR PASS時，
請記得於乘車日的前一天(或更早)到 JR 東日本各車站的みどりの窓口取票。
(註：北陸新幹線通車後，部份路線的車票也可以在JR西日本北陸新幹線的車站取票。)
雖然在東日本常常看到廣告寫著えきねっと訂位可以在指定席券売取票，
不過フリーパス型的特別企画乗車券無法在指定席券売取票，
所以還是得乖乖到綠色窗口跟售票員說上幾句話。
建議到大一點的車站取票，大車站的窗口比較多也比較有處理這類車票的經驗。
取票時必須帶著註冊時登記的信用卡以及五碼的予約番号(訂位代碼)，
請注意是要給予約番号，而不是把要搭的班次全部重寫一次在紙上，
這樣的話售票員會照著紙上寫的班次另外劃位，
然後原本在網路上訂到的位子最後就會變成逾期未取然後必須付鉅額的票款。
(印象中先前PTT有板友發生過此類憾事……)
筆者的習慣是另外印一張詳細的預約資訊留在手邊，
但是只給售票員予約番号，
等售票員把車票全部印出來要跟客人核對車票資訊時，
才把那張紙拿出來確認乘車日期/列車/區間/座位是否正確。
拿到車票後，
需再確認車票上的金額是否為「￥＊＊＊」，
以及車票的左下角是否有一行「えきねっと発券」的字樣，
如果是的話，那就大功告成了。
快適な鉄道の旅をお楽しみください～
圖片來源：JR東日本えきねっと網站
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